根據(jù)法律的規(guī)定，侵犯商業(yè)秘密賠償計算方式和商標(biāo)、專利計算方式大致相同：1、被侵權(quán)人因為侵權(quán)遭受的損失，2、侵權(quán)人因為侵權(quán)獲得的利益。但是我們注意到順序和商標(biāo)、專利不同，首選的方式是被侵權(quán)人的損失。下面分析具體運用：

1、被侵權(quán)人因為侵權(quán)遭受的損失

一般來說，確定侵犯商業(yè)秘密的實際損失應(yīng)當(dāng)充分的考慮以下因素：

(1)研制開發(fā)成本，包括花費的時間、金錢和付出的努力等，必須將該部分成本計入實際損失。

(2)現(xiàn)實的利益損失。使用商業(yè)秘密正在給權(quán)利人帶來的經(jīng)濟利益，涉及到生產(chǎn)成本的降低、銷售額的提高、利潤率的增加等。侵犯商業(yè)秘密造成權(quán)利人現(xiàn)實利益的喪失屬于實際損失。

(3)將來的競爭優(yōu)勢，即權(quán)利人對將來利益的合理預(yù)期。在因為披露而使商業(yè)秘密喪失的情況下，或者實際情況表明不易于責(zé)令停止違法行為的情況下，將來的競爭優(yōu)勢的喪失往往是實際損失的組成部分。確定此種損失應(yīng)當(dāng)考慮商業(yè)秘密新穎性的程度、經(jīng)濟價值的大小、利用周期的長短、市場競爭的程度、市場前景的預(yù)期等。

2、侵權(quán)人因為侵權(quán)獲得的利益

從侵害商業(yè)秘密行為的損害賠償實踐來看，計算實際損失往往是非常困難的，計算利潤則是相對比較容易的。就西安的案例而言，中冶連鑄公司與四川川威和山東泰山分別簽訂了板坯連鑄機的設(shè)計、安裝等總合同，兩個合同的總金額為1.48億余元，但是，由于從卷中現(xiàn)有的中冶連鑄公司的財務(wù)賬目中無法確定其因兩個合同所獲取的利潤。庭審中，原告的訴訟代理人向法庭提交了中國重型機械工業(yè)協(xié)會的專家評估意見，認(rèn)為板坯連鑄機成套設(shè)備設(shè)計、制造的平均銷售利潤為12%，按中冶連鑄公司簽訂的兩份合同的金額計算(7296萬元+7560萬元)×12%=1782萬元。合議庭認(rèn)為，賠償額采取此種方法計算是較為客觀的。

3、承擔(dān)合理的費用。

這個合理的費用與商標(biāo)、專利的相關(guān)規(guī)定差不多，都是調(diào)查取證的費用開支。是不是支持律師費，并沒有明確的規(guī)定，在司法實踐中，有的法院是會支持的。

4、連續(xù)侵權(quán)問題

連續(xù)侵權(quán)問題，商標(biāo)、專利最高院都有明確的解釋，但是商業(yè)秘密卻沒有。某些侵犯商業(yè)秘密的行為和侵犯商標(biāo)、專利權(quán)一樣是連續(xù)的，有的持續(xù)時間較長，此時，對損失額的計算，不能簡單地以被告的侵權(quán)所得為損失額，還必須考慮時效問題，如果被害人早已知道被告人的侵權(quán)行為，卻沒有采取任何措施，在超過訴訟時效之后，才向有關(guān)機關(guān)尋求救濟的，在審判實踐中，其損失額的計算應(yīng)當(dāng)自向有關(guān)機關(guān)尋求救濟之日起向前推算兩年計算，超過兩年的損失不予保護(hù)。