1、 申報明細與年度財務報表的關系既有聯系又有區別。申報明細與年度財務報表的關系，是指最近三個會計年度研究開發費用結構明細和最近一年高新技術產品（服務）收入明細的相關數據納入經審計的年度財務報表，而會計準則或會計準則適用于兩者的制度是一致的，相關會計政策和會計估計不存在差異。不過，申報明細與年度財務報表有所不同。根據《高新技術企業認定管理辦法》和《高新技術企業認定管理指引》，編制最近三個會計年度的研發支出結構明細表和最近一年的高新技術產品（服務）收入明細表高新技術企業。所提供的數據能夠直接反映企業是否符合認定條件。二是實施專項審計，無論企業以前年度財務報表是否經注冊會計師審計，或者專項審計與年度財務報表是否由同一會計師事務所承擔，專項審計可以按照《專項審計準則》的規定，獨立實施審計程序。如果結合上一年度的財務報表審計，確定的重要性水平應低于相應財務報表審計的重要性水平。在確定審計范圍時，應考慮從上一年度財務報表審計中獲得的審計證據的程度。應該注意的是，重要性的性質和數量應結合具體環境加以考慮。三是對高新技術產品或者服務的認定進行專項審計的要求。注冊會計師不是高新技術領域的專家，因此《專項審計指引》作出了以下規定：（一）申報企業有責任正確界定研發項目和高新技術產品（服務）的具體范圍。（2） 管理權限聲明由申請企業的技術負責人、法定代表人、財務負責人共同簽署。

但《專項審計指導意見》也規定，在制定總體審計戰略時，應當明確分配給具體審計領域的資源，包括聘請研究開發項目復雜技術問題專家的工作。四是風險導向審計理念在專項審計中的應用《專項審計指導意見》要求對研發項目和高新技術產品（服務）應了解申請人及其環境，如申請人產品（服務）的技術變化，申請人研發部門的設置和分布情況，是否有專門的機構和人員需要了解固定資產在研發活動中的投入情況以及投入資金的來源，申報企業是否制定了創建科技創新型企業的發展戰略，是否將高新技術產品（服務）收入作為主要績效評價指標。

專項審計指引要求從申報明細、各項交易、列報確認等層面識別和評估重大錯報風險。需要從整體上判斷申報細節層面的重大錯報風險。如申報企業不能提供研發項目的相關計劃和實施方案及研發記錄，申報明細整體上可能存在重大錯報風險。在申報明細層面的重大錯報風險很可能源于薄弱的控制環境，特別是當其優于內部控制制度時，很可能偽造或篡改編制申報明細所依據的會計記錄或相關文件。

“專項審計指引”要求注冊會計師假設申報企業的高新技術研發費用和高新技術產品（服務）收入存在欺詐風險，應當考慮申報企業管理層可能有申請會計師資格的動機高新技術企業享受稅收優惠政策，導致高新技術研發費用和高新技術產品（服務）收入存在重大錯報風險的。特別審計準則概述了與申報細節有關的內部控制制度，強調了解這些內部控制是識別和評估重大錯報風險以及設計和實施進一步審計程序的基礎。

與高新技術產品（服務）收入有關的內部控制納入企業產品或服務的銷售控制。例如，當高新技術產品（服務）的收益與研發激勵或銷售激勵相關時，企業通常會設計或增加相應的控制環節。注冊會計師在進行審計時，需要了解申報企業是否能夠保證銷售額的準確記錄，并對高新技術產品（服務）進行適當的分類。

在財務報表審計中，與高新技術研發支出相關的內部控制一般沒有具體提及。《專項審計指引》強調，研發費用控制通常是申報企業費用和成本控制的重要組成部分。這就要求注冊會計師在了解研發費用的控制時，必須考慮影響研發費用的完整性、發生性、準確性和分類的控制點。同時，《專項審計指引》給出了研發業務流程通常可能包括的主要活動，如項目審批和預算管理、人員管理、物資設備管理、項目收尾管理等。6專項審計報告的審計為申請高新技術企業的認定，申報企業通常委托對最近三個會計年度的研發支出結構明細表和最近一個會計年度的高新技術產品（服務）收入明細表進行專項審計同時也是一家會計師事務所。按照專項審計指引的要求，完善研發支出結構，分別出具專項審計報告。

由于研發費用結構明細表涉及三個會計年度，注冊會計師在出具非標準專項審計報告時需要明確相應的會計年度。以上是小編為您整理的相關知識。相信通過以上的知識你已經有了一個大致的了解。如果您仍然遇到任何更復雜的法律問題，歡迎您登錄律師網律師在線咨詢。你知道嗎