根據(jù)《土地管理法》的有關(guān)規(guī)定，非法占用土地的處罰方式主要包括：

①責令退還非法占用的土地。即將非法占用的土地恢復(fù)到占用以前的狀態(tài)，如果非法占用的土地是公共用地或未確定給單位和個人使用的國有土地的，要恢復(fù)到占用以前的原貌;如果非法占用的土地是其他單位和個人使用的國有土地的，要將非法占用的土地退還原使用者，由此而給原使用者造成損失的，可以依法追究違法使用者的民事責任;如果非法占用的土地是農(nóng)民集體經(jīng)濟組織的，作出處罰決定的土地行政主管部門應(yīng)當責令其交還原農(nóng)民集體經(jīng)濟組織。

②限期拆除新建的建筑物和其他設(shè)施。

如果在非法占用的農(nóng)用地上新建了建筑物和其他設(shè)施的，并且這些建筑物和其他設(shè)施是違反土地利用總體規(guī)劃的，作出處罰決定的土地行政主管部門應(yīng)當責令違法者在一定期限內(nèi)予以拆除，恢復(fù)土地原狀。

③沒收新建的建筑物和其他設(shè)施。

如果在非法占用的土地新建的建筑物和其他設(shè)施是符合土地利用總體規(guī)劃的，作出處罰決定的土地行政主管部門應(yīng)當予以沒收。

④罰款。

對非法占用土地的，除采取上述處罰措施以外，還可以對當事人處以罰款，但罰款是選擇性適用條款，是否給予罰款，由土地行政主管部門根據(jù)違法情節(jié)而定，至于罰款的具體幅度和標準，應(yīng)由《土地管理法實施條例》作出明確規(guī)定。對非法占用土地的，對當事人處以罰款，《土地管理法實施條例》第四十二條規(guī)定，罰款額為非法占用土地每平方米30元以下。

⑤行政處分。

給予行政處分的對象是非法占地單位的直接負責的主管人員和其他直接責任人員。給予行政處分的依據(jù)是《國務(wù)院關(guān)于行政機關(guān)工作人員獎懲暫行規(guī)定》和《企業(yè)職工獎懲條例》。行使行政處分的機關(guān)是有關(guān)責任人員的所在單位或者上級機關(guān)。

⑥刑事責任。

主要是指非法占用土地的行為情節(jié)嚴重，觸犯《中華人民共和國刑法》第三百四十二條時，行為人應(yīng)當承擔刑事法律責仃，包括有期徒刑或者拘役、單處或者并處罰金等。需要說明的是，構(gòu)成此罪，必須是非法占用耕地。《中華人民共和國刑法》第三百四十二條規(guī)定，違反土地管理法規(guī)，非法占用耕地、林地等農(nóng)用地，改變被占用土地用途，數(shù)量較大，造成耕地、林地等農(nóng)用地大量毀壞的，處五年以下有期徒刑或者拘役，并處或者單處罰金。