如果是員工與用人單位之間因為保密協議書產生的糾紛，屬于勞動仲裁范圍，應先申請勞動仲裁，對仲裁不服才能去法院起訴。如果是企業與企業之間、或者企業與非員工之間，因為保密協議書之間產生的糾紛，不屬于勞動仲裁范圍，屬于一般的民事糾紛，直接向法院起訴，勞動仲裁不受理。

保密協議的爭議如何解決

保密協議中主要是勞動者單方保守用人單位的商業秘密的義務。《中華人民共和國勞動爭議調解仲裁法》的第4條規定：“發生勞動爭議，勞動者可以與用人單位協商，也可以請工會或者第三方共同與用人單位協商，達成和解協議。”第4條規定：“發生勞動爭議，當事人不愿協商、協商不成或者達成和解協議后不履行的，可以向調解組織申請調解;不愿調解、調解不成或者達成調解協議后不履行的，可以向勞動爭議仲裁委員會申請仲裁;對仲裁裁決不服的，除本法另有規定的外，可以向人民法院提起訴訟。”

勞動和社會保障部辦公廳《關于勞動爭議案中涉及商業秘密侵權問題的函》(勞社廳函〔1999〕69號)“勞動合同中如果明確約定了有關保守商業秘密的內容，由于勞動者未履行，造成用人單位商業秘密被侵害而發生勞動爭議，當事人向勞動爭議仲裁委員會申請仲裁的，仲裁委員會應當受理，并依據有關規定和勞動合同的約定作出裁決。”

如果保密協議作為勞動合同的一部分，則屬于勞動爭議的范圍，需要勞動仲裁前置程序。如果企業與勞動者以自愿為前提在勞動合同外，單獨簽訂勞動合同則可以依據當事人的約定的解決方式，不必先經勞動仲裁。

我國刑法也為保護商業秘密提供了救濟途徑。《刑法》第219條的規定：“有下列侵犯商業秘密行為之一，給商業秘密的權利人造成重大損失的，處三年以下有期徒刑或者拘役，并處或者單處罰金;造成特別嚴重后果的，處三年以上七年以下有期徒刑，并處罰金：(一)以盜竊、利誘、脅迫或者其他不正當手段獲取權利人的商業秘密的;(二)披露、使用或者允許他人使用以前項手段獲取的權利人的商業秘密的;(三)違反約定或者違反權利人有關保守商業秘密的要求，披露、使用或者允許他人使用其所掌握的商業秘密的。明知或者應知前款所列行為，獲取、使用或者披露他人的商業秘密的，以侵犯商業秘密論。本條所稱商業秘密，是指不為公眾所知悉，能為權利人帶來經濟利益，具有實用性并經權利人采取保密措施的技術信息和經營信息。本條所稱權利人，是指商業秘密的所有人和經商業秘密所有人許可的商業秘密使用人。”

最高人民檢察院、公安部《關于公安機關管轄的刑事案件立案追訴標準的規定(二)》第73條的規定：“[侵犯商業秘密案(刑法第二百一十九條)]侵犯商業秘密，涉嫌下列情形之一的，應予立案追訴：(一)給商業秘密權利人造成損失數額在五十萬元以上的;(二)因侵犯商業秘密違法所得數額在五十萬元以上的;(三)致使商業秘密權利人破產的;(四)其他給商業秘密權利人造成重大損失的情形。”

以上就是小編為您整理的內容，保密協議是否適用勞動仲裁，需要根據具體情況來確定，如果是勞動者與用人單位之間的保密協議，這屬于勞動爭議，是可以適用勞動仲裁的。如果你情況比較復雜，律霸網也提供律師在線咨詢服務，歡迎您進行法律咨詢。