如何分配土地股份的利益，法律沒有明確規(guī)定。根據《財政部、國家稅務總局關于股權轉讓有關營業(yè)稅問題的通知》（財稅[2002]191號），投資無形資產和房地產的行為不征收營業(yè)稅，參與投資者的利潤分配，共同承擔投資風險。因此，母公司以土地使用權作為投資，參與投資者的利潤分配，共同承擔投資風險，不征收營業(yè)稅。二是《財政部、國家稅務總局關于土地增值稅若干具體問題的通知》（財稅字[1995]48號）第一條規(guī)定，對房地產投資和合營企業(yè)，投資、合營一方投資土地（不動產）或將不動產轉讓給投資、合營一方，投資、合營一方再次轉讓上述不動產的，征收土地增值稅。根據《財政部、國家稅務總局關于土地增值稅若干問題的通知》（財稅[2006]21號）第五條規(guī)定，國家稅務總局、國家稅務總局對投資、聯營房地產開發(fā)的企業(yè)，以及投資、聯營其建設的商品房的房地產開發(fā)企業(yè)，不適用《國家稅務總局關于土地若干具體問題的通知》《增值稅》（財稅字[1995]48號）第一條土地增值稅暫免規(guī)定。因此，子公司不從事房地產開發(fā)的，母公司轉讓土地使用權可以免征土地增值稅；子公司從事房地產開發(fā)的，母公司應當按照《土地增值稅暫行條例》第七條和國家稅務總局關于印發(fā)《土地增值稅宣傳綱要》的通知（國稅發(fā)[1995]110號），“（一）土地或者房地產使用權取得后未經開發(fā)轉讓的，計算增值時只能扣除土地使用權、使用權時支付的地價、支付的相關費用、轉讓環(huán)節(jié)繳納的稅費。（2） 取得土地使用權后，以投資方式將原土地轉為成熟土地的，在計算增值額時，允許扣除已支付的地價、相關費用、土地開發(fā)成本，加上開發(fā)成本的20%和轉讓環(huán)節(jié)已繳納的稅費。”以及其他相關規(guī)定。根據《中華人民共和國稅收征收管理法》第三十六條，外國企業(yè)在中國境內設立的從事生產、經營的企業(yè)或者組織、場所與其關聯企業(yè)之間的業(yè)務往來，按照獨立企業(yè)之間的業(yè)務往來收取或者支付；稅務機關根據獨立企業(yè)之間的業(yè)務往來，不收取或者不支付價款、費用，減少應納稅所得額或者所得額的，有權作出合理調整。

根據上述規(guī)定，母公司按規(guī)定繳納土地增值稅的，母公司按土地成本價對子公司進行投資，視為不按獨立企業(yè)之間的業(yè)務往來收取或支付價款和費用，稅務機關可以合理調整應納稅額。三是企業(yè)所得稅法實施細則第十三條規(guī)定，企業(yè)所得稅法第六條所稱非貨幣形式取得的收入，應當按照公允價值確定。前款所稱公允價值，是指按照市場價格確定的價值。根據《國家稅務總局關于企業(yè)處置資產所得稅處理的通知》（國稅函[2008]828號）第二條規(guī)定，因資產權屬發(fā)生變化而不屬于內部處置資產的其他用途，應當作為銷售收入。根據第三條規(guī)定，企業(yè)符合本通知第二條規(guī)定情形時，自制資產的銷售收入，按照企業(yè)同期同類資產對外銷售價格確定；外購資產的銷售收入，按照當時價格確定購買日期。

根據上述規(guī)定，母公司以土地使用權投資于子公司的，母公司轉讓土地使用權視為出售；母公司按所購土地的成本價投資于子公司。取得的土地除購買外，銷售收入可以按照購買時的價格確定。根據企業(yè)所得稅法第四十一條的規(guī)定，關聯企業(yè)之間的業(yè)務往來不符合獨立交易原則，減少企業(yè)或者關聯方應納稅所得額或者所得額的，稅務機關對依法可以調整的，有權作出合理的決定。根據《企業(yè)所得稅法》第八條的規(guī)定，母公司的征地成本、稅金等費用可以稅前扣除。

母公司擬出資的土地使用權原賬面余額為1000萬元，本次評估增值額為5000萬元，雙方確認的公允價值為5000萬元的，確認資產轉讓收入4000萬元，依法計算繳納企業(yè)所得稅。4印花稅2006年11月27日以后，投資后簽訂土地使用權出讓合同的，應當繳納印花稅。稅率是萬分之五。根據《國家稅務總局關于印花稅若干政策的通知》（財稅[2006]162號）第三條規(guī)定，土地使用權出讓合同和土地使用權出讓合同，按照產權轉讓文件征收印花稅。

根據上述規(guī)定，母公司投資合同涉及的土地使用權轉讓，應當按照《產權轉讓證明》進行粘貼。5契稅國有土地使用權投資按規(guī)定繳納契稅。契稅稅率為3%-5%。《中華人民共和國契稅暫行條例實施細則》第八條：土地、房屋所有權以下列方式轉讓的，視為土地使用權轉讓、房屋買賣或者房屋贈與，土地、房屋所有權作為投資和股份。上述內容是對“土地入股時如何分配利益”問題的回答。如果讀者需要法律幫助，歡迎使用律師網進行法律咨詢。你知道嗎