(一)農(nóng)業(yè)植物新品種申請保護(hù)的品種構(gòu)成不合理農(nóng)業(yè)植物新品種保護(hù)的申請及授權(quán)數(shù)量少，品種構(gòu)成也不合理。從申請數(shù)量上看，盡管每年申請的數(shù)量都在不斷增加，但與發(fā)達(dá)國家相比仍有較大的差距。從構(gòu)成上來看，品種分布很不均勻，申請植物新品種權(quán)的農(nóng)作物主要是玉米、水稻、小麥等大田作物，占到了申請總量的90%以上，其他農(nóng)產(chǎn)品申請數(shù)量較少，甚至是空白。以遼寧省為例，近幾年來遼寧省每年取得的育種科技成果高達(dá)500多項，而其中申請植物新品種保護(hù)的還不足15%，已申請品種保護(hù)的也主要以玉米、水稻為主，大豆、蔬菜、果樹品種很少。

(二)植物新品種產(chǎn)權(quán)意識薄弱

我國是實(shí)行知識產(chǎn)權(quán)制度較晚的國家，植物新品種保護(hù)制度作為一項新的知識產(chǎn)權(quán)制度在我國也才剛剛實(shí)施四年多的時間，這使得廣大科研單位和科研人員對植物新品種保護(hù)的重要作用沒有充分的認(rèn)識，知識產(chǎn)權(quán)意識薄弱，對植物新品種保護(hù)的戰(zhàn)略意義缺乏足夠的了解和認(rèn)識，品種權(quán)申請數(shù)量少。全國有400多個育種研究所，7500多個農(nóng)作物種子企業(yè)，而四年多來向國內(nèi)申請的品種權(quán)僅有千件左右，平均8個單位一件，向外國申請的更是寥寥無幾。據(jù)初步統(tǒng)計，植物新品種保護(hù)制度實(shí)施四年多來，經(jīng)省級以上品種審定委員會審定通過的主要農(nóng)作物新品種約5000個，而提出農(nóng)業(yè)植物新品種權(quán)申請的新品種數(shù)量不足1000件。

(三)維權(quán)困難，地方保護(hù)主義嚴(yán)重

農(nóng)作物種植和種子生產(chǎn)經(jīng)營活動的季節(jié)性很強(qiáng)，對侵權(quán)案件的取證本身就十分困難，一些地方政府為保護(hù)本地利益，直接或間接插手種子行業(yè)，違規(guī)設(shè)置障礙排斥外來企業(yè)和優(yōu)良品種，甚至袒護(hù)本地違規(guī)侵權(quán)單位，阻撓執(zhí)法部門查處。

同時，維權(quán)訴訟程序復(fù)雜，品種侵權(quán)案件要有指定的的省級以上法院審理，路途遠(yuǎn)，成本高，育種專家沒有時間和精力。而且植物新品種的保護(hù)規(guī)定中沒有規(guī)定有關(guān)品種保護(hù)的法定賠償金額，使司法部門在執(zhí)法時遇到較大的困難，尤其是碰到既難確定侵權(quán)人的非法獲利又難確認(rèn)被侵權(quán)人的實(shí)際損失的情況下，不同地區(qū)的法院在處理基本相同的植物新品種保護(hù)的侵權(quán)糾紛時，判決的賠償額可能有著驚人的差異。

(四)審查速度較慢，不適應(yīng)植物新品種保護(hù)發(fā)展的需要

目前，新品種保護(hù)組織管理體制還沒有完全理順，品種權(quán)初審、實(shí)審、復(fù)審、無效等程序尚未有效建立和順利運(yùn)轉(zhuǎn)，再加上由于資金短缺而造成的品種權(quán)審查測試技術(shù)支撐體系建設(shè)滯后，人員數(shù)量和質(zhì)量不能滿足發(fā)展的需要，便利審查速度難以加快，不利于品種權(quán)申請人合法權(quán)益及時得到有效的保護(hù)，反過來影響育種者和育種單位對植物新品種保護(hù)申請的積極性。(五)植物新品種保護(hù)的覆蓋面應(yīng)當(dāng)進(jìn)一步擴(kuò)大

通過自主創(chuàng)新取得與掌握品種權(quán)是保護(hù)國家種質(zhì)資源的重要的方式。我國是八大作物起源中心之一，生物遺傳資源非常豐富，隨著我國農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)對外開放及農(nóng)產(chǎn)品國際貿(mào)易的日益擴(kuò)大，外國企業(yè)到我國申請品種權(quán)將后迅速增加，特別是一些種業(yè)跨國公司，依靠其先進(jìn)技術(shù)優(yōu)勢，不但將其某個具有現(xiàn)實(shí)及潛在經(jīng)濟(jì)價值的植物新品種在該國申請品種權(quán)，還將某些發(fā)展中國家的優(yōu)良品種在這些國家申請并取得屬于他們自己的品種權(quán)。因此，必須擴(kuò)大植物新品種保護(hù)的覆蓋面，使我國的植種質(zhì)資源通過品種保護(hù)“留住”，而不是“流失”。

(六)對品種權(quán)作為國際農(nóng)產(chǎn)品貿(mào)易壁壘的作用及其發(fā)展動向研究不足

植物新品種保護(hù)制度還影響了國際農(nóng)產(chǎn)品貿(mào)易的格局，許多國家尤其是發(fā)達(dá)國家出于保障國家經(jīng)濟(jì)戰(zhàn)略安全以及保護(hù)農(nóng)產(chǎn)品競爭優(yōu)勢的考慮，紛紛采用植物品種保護(hù)制度保障自身的優(yōu)質(zhì)品種壟斷，并在全球范圍內(nèi)申請保護(hù)，以此來控制國外農(nóng)產(chǎn)品的進(jìn)口，使得品種權(quán)成為新的國際農(nóng)產(chǎn)品貿(mào)易壁壘。可以說，在日趨激烈的國際農(nóng)產(chǎn)品貿(mào)易戰(zhàn)的背后是“種子戰(zhàn)”和“品種戰(zhàn)”。在新的貿(mào)易關(guān)系下，面對中國巨大的市場，國外在中國的植物品種權(quán)申請必將日益增多，因此，我國應(yīng)當(dāng)重視品種權(quán)作為國際農(nóng)產(chǎn)品貿(mào)易壁壘的重要作用，積極采取措施，最大限度的保護(hù)我國品種權(quán)人、企業(yè)與農(nóng)民的利益。

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