各級衛(wèi)生廳(局)是各級醫(yī)療單位的行政主管部門,它不但確定各級各類醫(yī)療單位及醫(yī)護人員的最低資格條件及在取得資格后必須遵守的規(guī)則和要求,而且在發(fā)生醫(yī)療糾紛后擁有調(diào)查、調(diào)解、裁決和處罰的權利。在行政管理法律關系中，衛(wèi)生主管部門是行政主體，各級醫(yī)療單位是直接行政相對人，患者在醫(yī)療糾紛中是利害關系人，行政機關對醫(yī)療單位的行政管理必然會對其產(chǎn)生影響而使其成為間接相對人。

實踐中，由于畏訴和對訴訟經(jīng)濟的考慮，患者及其家屬在發(fā)生醫(yī)療糾紛后，往往先向衛(wèi)生主管部門(我國目前醫(yī)療鑒定委員會設在其中的醫(yī)政部門)投訴，要求調(diào)查和鑒定。經(jīng)調(diào)查和鑒定后，根據(jù)醫(yī)療糾紛的性質(zhì)及經(jīng)濟賠償數(shù)額的大小，衛(wèi)生行政部門可對醫(yī)患雙方的糾紛主持調(diào)解，如果調(diào)解失敗，再轉由司法機構依法處理。同時可依照《國務院醫(yī)療機構管理條例》和《執(zhí)業(yè)醫(yī)師法》給予醫(yī)療單位和直接責任人以相應的行政處罰和行政處分，它主要有：

1，財產(chǎn)罰?；谶`法或違章行醫(yī)而致的醫(yī)療糾紛，可給予醫(yī)療單位一定數(shù)額的罰款，或沒收財產(chǎn)(如未達法定標準的、能嚴重影響病人安全和健康的醫(yī)療器械，各種假藥劣藥等)。

2，行為罰。符合《執(zhí)業(yè)醫(yī)師法》第37條規(guī)定，情節(jié)較重的，或由于醫(yī)院嚴重管理混亂而致的醫(yī)療糾紛，衛(wèi)生行政機關可暫扣或吊銷直接責任人的《醫(yī)師職業(yè)證書》或《護士職業(yè)證書》，暫扣或吊銷責任醫(yī)療單位的行醫(yī)許可證。

3，申戒罰?；卺t(yī)療單位管理不善而致的醫(yī)療糾紛，可給予警告、通報批評或限期改正等措施。對于醫(yī)師責任符合《執(zhí)業(yè)醫(yī)師法》第37條規(guī)定，情節(jié)較輕的，可給予警告或責令暫停執(zhí)業(yè)活動。

4，行政處分。直接責任人或直接負責的主管人員在醫(yī)療糾紛中負有責任的，可依責任大小比照國家公務員暫行條例，給予警告、記過、記大過、降級、撤職、開除等行政處分。《醫(yī)療事故處理辦法》第20條規(guī)定：對造成醫(yī)療責任事故的直接責任人員，醫(yī)療單位應當根據(jù)其事故等級、情節(jié)輕重、本人態(tài)度和一貫表現(xiàn)，分別給予以下行政處分：

一級醫(yī)效事故：記大過、降級、降職、撤職、開除留用察看、開除;

二級醫(yī)效事故：記過、記大過、降級、降職、撤職;

三級醫(yī)效事故：警告、記過、記大過、降級、降職。

《醫(yī)療事故處理辦法》第21條規(guī)定：對造成醫(yī)療技術事故的直接責任人員，醫(yī)療單位應責令其作出書面檢查，吸取教訓，一般可免予行政處分;對情節(jié)嚴重的，也應當依照本辦法第20條的規(guī)定，酌情給予行政處分。但行政機關是憑借何種權利而對有獨立法人地位的事業(yè)單位人員進行處分的，這有待商榷。