一、股權轉讓糾紛公司能否作為被告

股權轉讓糾紛，公司能作為被告，但是也是分幾種情況的。

(一)股權轉讓雙方之間的糾紛

涉及到轉讓雙方之間的股權轉讓合同糾紛，如請求履行轉讓合同，請求支付股權轉讓款并賠償損失或支付違約金，或者請求解除轉讓合同，請求認定轉讓合同無效等等。這類糾紛主要適用合同法的有關規定進行處理，應列合同的相對人為被告，涉及到公司利益的，應列公司為第三人。

(二)涉及其他股東優先購買權的訴訟糾紛

這類糾紛需要結合公司法與合同法相關規定進行處理，應列出讓股權的股東為被告，公司為第三人，涉及其他的股東利益，一并追加為第三人。

(三)股權善意取得引發的糾紛案件

此類糾紛多產生于其他股東對于股權轉讓存在異議，一般是其他股東作為原告，而善意取得第三人與公司為被告。

(四)股權轉讓糾紛中涉及公司決議的糾紛案件

股權轉讓糾紛中涉及公司決議無效或撤銷，當事人起訴請求確認股東會或者股東大會、董事會決議無效或者請求撤銷上述決議的，應當列公司為被告，對決議涉及的相對利害關系人，可以列為共同被告或者第三人。

二、法律依據：

《中華人民共和國公司法》第七十一條

有限責任公司的股東之間可以相互轉讓其全部或者部分股權。 股東向股東以外的人轉讓股權，應當經其他股東過半數同意。股東應就其股權轉讓事項書面通知其他股東征求同意，其他股東自接到書面通知之日起滿三十日未答復的，視為同意轉讓。其他股東半數以上不同意轉讓的，不同意的股東應當購買該轉讓的股權;不購買的，視為同意轉讓。 經股東同意轉讓的股權，在同等條件下，其他股東有優先購買權。兩個以上股東主張行使優先購買權的，協商確定各自的購買比例;協商不成的，按照轉讓時各自的出資比例行使優先購買權。 公司章程對股權轉讓另有規定的，從其規定。

三、股權轉讓糾紛怎么確定管轄

按照我國《民事訴訟法》及最高院司法解釋的規定，合同糾紛，由被告住所地或合同履行地人民法院管轄。如果合同沒有實際履行，當事人雙方住所地又都不在合同約定的履行地的，應由被告住所地人民法院管轄。同時，法律賦予當事人協議約定管轄法院的權利，即合同的雙方當事人可以在書面合同中協議選擇被告住所地、合同履行地、合同簽訂地、原告住所地、標的物所在地人民法院管轄，但不得違反民訴法對級別管轄和專屬管轄的規定。

在股權轉讓協議糾紛中，如果雙方當事人對管轄法院有約定且約定有效的，應適用其約定;沒有約定或約定不明，應適用法律規定，即由被告住所地或合同履行地人民法院管轄。

對于被告所在地，人們一般不會有歧義。而對于股權轉讓的合同履行地，應為股權轉讓的目標公司的公司注冊地。因為，公司股權轉讓糾紛的特殊性在于轉讓行為需要向公司注冊地的登記機關履行相應手續方可完成(如果是外資企業，在工商變更之前還需要商務主管部門的批復，否則股權轉讓合同不生效)，因此，以公司注冊地作為此類案件的管轄地也是國際上通行的做法。