一、實(shí)施方案
　　（一）２４２個(gè)科研機(jī)構(gòu)按照實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的總體要求，從實(shí)際情況出發(fā)，自主選擇改革方式，包括轉(zhuǎn)變成科技型企業(yè)、整體或部分進(jìn)入企業(yè)和轉(zhuǎn)為技術(shù)服務(wù)與中介機(jī)構(gòu)等。經(jīng)國(guó)家批準(zhǔn)繼續(xù)保留事業(yè)單位性質(zhì)的少數(shù)科研機(jī)構(gòu)，也要引進(jìn)科技型企業(yè)運(yùn)行機(jī)制。
　　（二）科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制時(shí)，按照有關(guān)法律、法規(guī)的要求，其現(xiàn)有全部國(guó)有資產(chǎn)（包括土地使用權(quán)）轉(zhuǎn)為國(guó)有資本金。
　　（三）科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制為科技型企業(yè)時(shí)，要在工商行政管理部門登記注冊(cè)為企業(yè)法人；有條件的可以依照《中華人民共和國(guó)公司法》改制為有限責(zé)任公司或股份有限公司；注冊(cè)名稱可用原科研機(jī)構(gòu)名稱（去掉原主管部門）或用符合登記規(guī)定的其他名稱。
　　科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制為科技型企業(yè)并實(shí)行屬地化管理的，要到所在省、自治區(qū)、直轄市工商行政管理部門登記注冊(cè)，其國(guó)有資產(chǎn)、人員編制、勞動(dòng)工資等均劃歸地方政府管理。其中規(guī)模較大的，在改制后５年過(guò)渡期內(nèi)，可由地方政府代表、國(guó)務(wù)院有關(guān)部門代表、有資金注入的相關(guān)行業(yè)骨干企業(yè)代表和本單位代表組成理事會(huì)。理事會(huì)的主要職責(zé)是，確定企業(yè)的發(fā)展方向和主要領(lǐng)導(dǎo)人的人選。
　　對(duì)少數(shù)轉(zhuǎn)制為中央直屬的大型科技型企業(yè)，由原主管國(guó)家局推薦，經(jīng)科技部、國(guó)家經(jīng)貿(mào)委、人事部審核并報(bào)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)后，到國(guó)家工商行政管理部門登記注冊(cè)；其子公司或子企業(yè)以及直屬分支機(jī)構(gòu)到所在省、自治區(qū)、直轄市工商行政管理部門登記注冊(cè)。其資產(chǎn)管理及有關(guān)財(cái)務(wù)關(guān)系交由財(cái)政部負(fù)責(zé)，領(lǐng)導(dǎo)干部的職務(wù)交由中央企業(yè)工委、人事部管理。
　　科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制為科技型企業(yè)后，要建立現(xiàn)代企業(yè)制度，按社會(huì)主義市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)的新機(jī)制運(yùn)行，在經(jīng)營(yíng)、管理方面依法享有充分的自主權(quán)。同時(shí)，要加強(qiáng)研究開發(fā)工作，保持企業(yè)的持續(xù)創(chuàng)新能力。
　　（四）科研機(jī)構(gòu)進(jìn)入企業(yè)后，可作為企業(yè)的技術(shù)開發(fā)機(jī)構(gòu)、子公司或其他分支機(jī)構(gòu)。進(jìn)入國(guó)有獨(dú)資企業(yè)的，其國(guó)有資產(chǎn)劃轉(zhuǎn)給所進(jìn)企業(yè)；進(jìn)入其他企業(yè)的，其資產(chǎn)經(jīng)評(píng)估后作為國(guó)有資產(chǎn)投資，由地方政府對(duì)投入的國(guó)有資產(chǎn)進(jìn)行監(jiān)管。
　　（五）少數(shù)科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)為技術(shù)服務(wù)與中介機(jī)構(gòu)的，經(jīng)國(guó)家批準(zhǔn)，可保留事業(yè)單位性質(zhì)，實(shí)行企業(yè)化運(yùn)營(yíng)。按照屬地化原則，這類機(jī)構(gòu)原則上交由所在省、自治區(qū)、直轄市政府管理，其資產(chǎn)、人員編制和經(jīng)費(fèi)同時(shí)劃轉(zhuǎn)。
　　（六）科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后，國(guó)家確認(rèn)的技術(shù)認(rèn)證和質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)中心、進(jìn)出口商檢中心，要保持相關(guān)機(jī)構(gòu)和人員的穩(wěn)定，經(jīng)國(guó)務(wù)院有關(guān)部門審核認(rèn)定后，繼續(xù)承擔(dān)國(guó)家交給的任務(wù)，接受國(guó)務(wù)院有關(guān)部門的監(jiān)督和業(yè)務(wù)指導(dǎo)，以保持其開展相關(guān)業(yè)務(wù)的公正性。對(duì)這類中心，國(guó)家財(cái)政繼續(xù)給予必要的經(jīng)費(fèi)支持。具體改革管理辦法由科技部會(huì)同質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局、國(guó)家經(jīng)貿(mào)委、財(cái)政部等另行制定。
　　（七）科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后，原具有學(xué)位授予權(quán)的，繼續(xù)列入國(guó)家招生計(jì)劃招收研究生，報(bào)國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)備案。研究生的培養(yǎng)要加強(qiáng)與高校的聯(lián)合，基礎(chǔ)課的授課任務(wù)可委托相關(guān)高校承擔(dān)。
　　（八）在轉(zhuǎn)制期間，２４２個(gè)科研機(jī)構(gòu)的現(xiàn)有領(lǐng)導(dǎo)班子要保持相對(duì)穩(wěn)定，確保國(guó)有資產(chǎn)不流失，日常工作仍以國(guó)家局管理為主。
　　（九）科研機(jī)構(gòu)不得違反國(guó)家有關(guān)規(guī)定辦理職工退休手續(xù)。

　二、配套政策
　　科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后，享受以下優(yōu)惠政策：
　　（一）原有的正常事業(yè)費(fèi)繼續(xù)撥付，主要用于解決轉(zhuǎn)制前已經(jīng)離休人員的社會(huì)保障問(wèn)題。
　　（二）職工養(yǎng)老保險(xiǎn)按以下辦法執(zhí)行：
　　轉(zhuǎn)制前已經(jīng)離退休的人員，原離退休金計(jì)發(fā)辦法不變，離退休金發(fā)放和日常管理工作由原單位負(fù)責(zé)。
　　轉(zhuǎn)制后的在職人員實(shí)行企業(yè)職工基本養(yǎng)老保險(xiǎn)制度。從１９９９年７月１日起，單位和個(gè)人按當(dāng)?shù)厝嗣裾?guī)定的比例繳納基本養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)，建立基本養(yǎng)老保險(xiǎn)個(gè)人帳戶。１９９９年７月１日前的連續(xù)工齡視同繳費(fèi)年限，不再補(bǔ)繳養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)。
　　轉(zhuǎn)制前參加工作、轉(zhuǎn)制后退休的人員，基本養(yǎng)老金計(jì)發(fā)按照企業(yè)職工基本養(yǎng)老保險(xiǎn)制度的規(guī)定執(zhí)行，對(duì)按企業(yè)基本養(yǎng)老金計(jì)發(fā)辦法低于原事業(yè)單位退休金計(jì)發(fā)辦法的部分，采用發(fā)補(bǔ)貼的辦法解決，所需費(fèi)用從基本養(yǎng)老保險(xiǎn)統(tǒng)籌基金中支付，補(bǔ)貼標(biāo)準(zhǔn)按國(guó)家有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。２００４年７月１日后退休的，執(zhí)行企業(yè)計(jì)發(fā)辦法。有條件的企業(yè)可建立補(bǔ)充養(yǎng)老保險(xiǎn)。企業(yè)要高度重視并保證科技人員退休后應(yīng)有的生活待遇。
　　轉(zhuǎn)制后參加工作的人員，按照規(guī)定執(zhí)行當(dāng)?shù)仄髽I(yè)職工基本養(yǎng)老保險(xiǎn)制度。
　　（三）基本建設(shè)項(xiàng)目投資由國(guó)家經(jīng)貿(mào)委、科技部和有關(guān)國(guó)家局商國(guó)家計(jì)委在過(guò)去５年平均水平的基礎(chǔ)上，結(jié)合在建項(xiàng)目的實(shí)際情況，繼續(xù)由中央給予兩年補(bǔ)助支持。
　　（四）從１９９９年起５年內(nèi)，免征企業(yè)所得稅，免征其技術(shù)轉(zhuǎn)讓收入的營(yíng)業(yè)稅，免征其科研開發(fā)自用土地的城鎮(zhèn)土地使用稅。科研機(jī)構(gòu)進(jìn)入企業(yè)仍然從事科技開發(fā)并實(shí)行獨(dú)立經(jīng)濟(jì)核算的，享有上述同等免稅政策。
　　（五）享有自營(yíng)進(jìn)出口權(quán)。
　　（六）享受國(guó)家支持科技型企業(yè)的待遇。
　　（七）參加國(guó)家科研課題和項(xiàng)目的申請(qǐng)、競(jìng)標(biāo)享有與其他科研機(jī)構(gòu)同等的權(quán)利。
　　（八）已經(jīng)批準(zhǔn)的科研課題和項(xiàng)目繼續(xù)按原計(jì)劃實(shí)施。

　三、組織實(shí)施
　　此項(xiàng)改革工作在國(guó)務(wù)院領(lǐng)導(dǎo)下，由國(guó)家經(jīng)貿(mào)委、科技部會(huì)同１０個(gè)國(guó)家局組織實(shí)施。各有關(guān)部門要認(rèn)真負(fù)責(zé)、積極穩(wěn)妥地做好工作，確保轉(zhuǎn)制工作按期完成。
　　（一）１０個(gè)國(guó)家局要指定專門辦事機(jī)構(gòu)，精心組織，制定所屬科研機(jī)構(gòu)的改革方案，在轉(zhuǎn)制過(guò)渡期內(nèi)，尤其要做好細(xì)致的思想政治工作，確保改革的順利進(jìn)行。
　　（二）科技部、國(guó)家經(jīng)貿(mào)委會(huì)同有關(guān)部門做好改革方案的協(xié)調(diào)和審核工作，監(jiān)督改革相關(guān)政策的執(zhí)行情況，及時(shí)協(xié)調(diào)解決改革過(guò)程中的出現(xiàn)的有關(guān)問(wèn)題。對(duì)轉(zhuǎn)制過(guò)程中遇到的重大問(wèn)題及時(shí)向國(guó)務(wù)院匯報(bào)。
　　（三）有關(guān)地方政府要認(rèn)真做好接納科研機(jī)構(gòu)的工作，妥善解決他們的困難，重視發(fā)揮他們的優(yōu)勢(shì)，加速科技產(chǎn)業(yè)化。不得隨意向這些單位安插人員，確保轉(zhuǎn)制工作高質(zhì)量、高效率、如期完成。
　　（四）國(guó)務(wù)院各有關(guān)部門要顧全大局，密切配合，不推諉、不扯皮，特事特辦，盡職盡責(zé)地對(duì)科研機(jī)構(gòu)的改革給予大力支持；
　　（五）改革實(shí)施的進(jìn)度安排：
　　１．１９９９年３月份啟動(dòng)并開展工作；
　　２．４月１０日前，１０個(gè)國(guó)家局要將所屬科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制方案報(bào)科技部、國(guó)家經(jīng)貿(mào)委匯總審核；由科技部、國(guó)家經(jīng)貿(mào)委、中編辦、財(cái)政部商有關(guān)部門，將審核后的轉(zhuǎn)制方案于４月２５日前報(bào)國(guó)務(wù)院審批；
　　３．轉(zhuǎn)制方案經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)后，由國(guó)家經(jīng)貿(mào)委及１０個(gè)國(guó)家局負(fù)責(zé)在６月３０日以前，完成所屬２４２個(gè)科研機(jī)構(gòu)的轉(zhuǎn)制工作。７月１日起開始按新的管理體制運(yùn)行。
　　完成轉(zhuǎn)制工作的標(biāo)志是：國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)科技部、國(guó)家經(jīng)貿(mào)委、中編辦、財(cái)政部上報(bào)的轉(zhuǎn)制方案并辦理完移交手續(xù)。對(duì)于清產(chǎn)核資、資產(chǎn)劃撥、工商登記注冊(cè)等具體手續(xù)，可適當(dāng)延長(zhǎng)一些時(shí)間，由國(guó)家經(jīng)貿(mào)委、科技部、１０個(gè)國(guó)家局以及有關(guān)部門協(xié)助抓緊進(jìn)行。
　　本實(shí)施意見由科技部負(fù)責(zé)解釋。
　　科學(xué)技術(shù)部
　　國(guó)家經(jīng)濟(jì)貿(mào)易委員會(huì)
　　中央機(jī)構(gòu)編制委員會(huì)辦公室
　　財(cái)政部
　　國(guó)家發(fā)展計(jì)劃委員會(huì)
　　勞動(dòng)和社會(huì)保障部
　　人事部
　　教育部
　　對(duì)外貿(mào)易經(jīng)濟(jì)合作部
　　國(guó)家稅務(wù)總局
　　國(guó)家工商行政管理局
　　國(guó)家質(zhì)量監(jiān)督局