即使法律、行政法規(guī)規(guī)定實(shí)施行政許可可以收取費(fèi)用，實(shí)施機(jī)關(guān)也不得自行收取費(fèi)用，還必須按照法定程序報(bào)經(jīng)有關(guān)部門批準(zhǔn)，核定收費(fèi)項(xiàng)目和標(biāo)準(zhǔn)。我國(guó)的行政事業(yè)性收費(fèi)項(xiàng)目和標(biāo)準(zhǔn)實(shí)行中央和省兩級(jí)審批。收費(fèi)項(xiàng)目按隸屬關(guān)系分別報(bào)國(guó)務(wù)院和省、自治區(qū)、直轄市人民政府的財(cái)政部門會(huì)同計(jì)劃(物價(jià))部門批準(zhǔn);制定和調(diào)整收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)，也要按隸屬關(guān)系分別報(bào)國(guó)務(wù)院和省級(jí)人民政府計(jì)劃(物價(jià))部門會(huì)同財(cái)政部門批準(zhǔn);重要項(xiàng)目及標(biāo)準(zhǔn)分別報(bào)國(guó)務(wù)院和省級(jí)人民政府批準(zhǔn)。省級(jí)人民政府批準(zhǔn)的行政事業(yè)性收費(fèi)項(xiàng)目和收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)報(bào)財(cái)政部、國(guó)家計(jì)委備案。省級(jí)以下人民政府及其各部門無權(quán)審批設(shè)立行政事業(yè)性收費(fèi)項(xiàng)目或調(diào)整收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)。面向農(nóng)民的行政事業(yè)性收費(fèi)，還應(yīng)當(dāng)經(jīng)主管農(nóng)業(yè)的部門審核。中國(guó)加入WTO工作組報(bào)告書曾經(jīng)對(duì)我國(guó)服務(wù)市場(chǎng)開放中的行政許可收費(fèi)提出了明確要求：“行政許可中的有關(guān)收費(fèi)應(yīng)當(dāng)與處理行政許可申請(qǐng)所需的行政費(fèi)用相當(dāng)，除非該費(fèi)用是通過拍賣或者招投標(biāo)等競(jìng)爭(zhēng)性方式確定的”。這可以理解為確定行政許可收費(fèi)項(xiàng)目和標(biāo)準(zhǔn)的一項(xiàng)原則。一般來說，行政許可收費(fèi)應(yīng)當(dāng)遵循非盈利和節(jié)約的原則，其收費(fèi)計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)以實(shí)際勞務(wù)和消耗支出為準(zhǔn)。實(shí)際收費(fèi)中，一些機(jī)關(guān)把行政許可收費(fèi)當(dāng)作是財(cái)政創(chuàng)收的一種手段，收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于實(shí)際成本，這是應(yīng)當(dāng)予以控制的。

二、收費(fèi)要公開

按國(guó)家規(guī)定程序批準(zhǔn)的行政事業(yè)性收費(fèi)，要公開收費(fèi)項(xiàng)目、范圍、標(biāo)準(zhǔn)，建立健全收費(fèi)許可證、收費(fèi)票據(jù)和年度審驗(yàn)、票據(jù)稽查制度。收費(fèi)單位必須到計(jì)劃(物價(jià))部門辦理收費(fèi)許可證，堅(jiān)持持證收費(fèi)，接受社會(huì)和群眾監(jiān)督;必須使用由省、自治區(qū)、直轄市以上財(cái)政部門統(tǒng)一制發(fā)的收費(fèi)票據(jù)或監(jiān)制的專用票據(jù)。沒有收費(fèi)許可證、沒有持證收費(fèi)、沒有使用規(guī)定票據(jù)的，任何單位或個(gè)人都可以拒絕交費(fèi)。任何組織和個(gè)人都有權(quán)向財(cái)政、計(jì)劃(物價(jià))部門檢舉違反國(guó)家規(guī)定的收費(fèi)行為。

三、收支兩條線

過去，一些地方為了緩解財(cái)政經(jīng)費(fèi)緊缺的情況，采取了行政機(jī)關(guān)執(zhí)行法律、法規(guī)，履行法定職責(zé)時(shí)收取的費(fèi)用，如許可收費(fèi)、處罰收入等，可以與財(cái)政分成的辦法。行政機(jī)關(guān)收取的費(fèi)用直接與本機(jī)關(guān)的行政經(jīng)費(fèi)、福利待遇相聯(lián)系，因而出現(xiàn)“收費(fèi)越多、經(jīng)費(fèi)越多、福利越好”的現(xiàn)象。這種辦法產(chǎn)生種種弊端，特別是導(dǎo)致一些行政機(jī)關(guān)一味地追求收費(fèi)和處罰，而忽視服務(wù)和管理。行政處罰法通過后，對(duì)罰沒收人實(shí)行收支兩條線管理，即罰沒收入全部上交財(cái)政，執(zhí)法機(jī)關(guān)所需費(fèi)用由財(cái)政撥款予以保障。這一制度的推行為解決行政機(jī)關(guān)借處罰牟利的問題發(fā)揮了積極的作用。目前，我國(guó)現(xiàn)已全面推行“執(zhí)收”分開的制度，實(shí)行“單位開票，銀行代收，財(cái)政統(tǒng)管”的管理體制，所有行政事業(yè)性收費(fèi)收入都應(yīng)當(dāng)及時(shí)、足額繳入國(guó)庫或預(yù)算外資金財(cái)政專戶。行政許可收費(fèi)，應(yīng)當(dāng)貫徹這一原則。所收取的費(fèi)用應(yīng)當(dāng)全部上繳國(guó)庫，不得截留、挪用、私分或者變相私分。財(cái)政部門也不得以任何形式向行政機(jī)關(guān)返還或者變相返還實(shí)施行政許可所收取的費(fèi)用。

第五十九條行政機(jī)關(guān)實(shí)施行政許可，依照法律、行政法規(guī)收取費(fèi)用的，應(yīng)當(dāng)按照公布的法定項(xiàng)目和標(biāo)準(zhǔn)收費(fèi);所收取的費(fèi)用必須全部上繳國(guó)庫，任何機(jī)關(guān)或者個(gè)人不得以任何形式截留、挪用、私分或者變相私分。財(cái)政部門不得以任何形式向行政機(jī)關(guān)返還或者變相返還實(shí)施行政許可所收取的費(fèi)用。