違章建筑是指違反《土地管理法》《城市規劃法》《建筑法》和《村莊和集鎮建設管理條例》等的規定建設的房屋及其設施。違章建筑主要包括：未申請或申請未獲得批準，未取得建設用地規劃許可證和建設工程規劃許可證而建成的建筑;擅自改變建設工程規劃許可證的規定建成的建筑;擅自改變使用性質建成的建筑，擅自將臨時建筑建設成為永久性的建筑。

首先，在拆遷補償中要注意區分違章建筑和建筑使用的材料。

根據我國《城市房屋拆遷管理條例》第二十二條規定：“拆除違章建筑和超過批準期限的臨時建筑，不予補償;拆除未超過批準期限的臨時建筑，應當給予適當補償。違章建筑人對違章建筑使用的材料享有合法的財產權。因此，拆遷人在拆除違章建筑時依法不給予補償，并不意味著對拆除違章建筑使用的材料也不給予補償。

其次，在拆遷補償中，要注意區分違章建筑和建筑范圍內的土地使用權。

違章建筑按照有無土地適用權的標準基本上可以分為兩類：一類是取得土地使用權的違章建筑，一類是未取得土地使用權的違章建筑。如果違章建筑具有合法的土地使用權，即使在拆遷時不就拆除違章建筑本身補償違章建筑人，也必須考慮土地使用權對違章建筑人的財產利益。如果土地使用權是通過劃撥方式得來的，拆遷人可以不補償使用該土地的違章建筑人;但是如果土地使用權是通過出讓方式得來，違法建筑人繳足了土地出讓金但出讓年限還未到期時，拆遷人應當就拆除違章建筑給違章建筑人造成的土地使用收益的損失予以適當補償。

再次，在拆遷補償中，要注意區分違章建筑和建筑內的財產。

違章建筑內的財產可以獨立于違章建筑存在，系違章建筑人的合法財產，依法應當受到保護。拆遷人在拆除違章建筑的過程中，不得侵犯違章建筑人的違章建筑內的合法財產權益，否則應當承擔法律責任。

另外，在拆遷補償中，要注意區分拆遷補償款和拆遷補助費。

雖然我國《國有土地上房屋征收與補償條例》明確規定：拆除違章建筑不予補償，但是這只能說明違章建筑人不能獲得拆遷補償款，拆遷人仍要依法向違章建筑人支付拆遷補助費。拆遷補助費包括搬遷補助費和臨時安置補助費等其它費用。拆遷人不得因違章建筑拒絕向違章建筑人支付搬遷補助費和臨時安置補助費等費拆遷補助費的請求。

拆遷補償是指拆遷人依法拆遷，應當給付被拆遷人和房屋承租人的補償;拆遷賠償是指拆遷人在拆遷過程中，由于拆遷程序和手段違法，侵害了被拆遷人和房屋承租人的合法權益時應當依法賠償損失。本文的拆遷賠償僅限于討論對違章建筑人的拆遷賠償。

最后，在拆遷補償中，要注意轉化的違章建筑的特殊情況。

所謂轉化的違章建筑，主要是指因為超過批準期限，由臨時建筑轉化成的違章建筑。轉化的違章建筑和批準期限內的臨時建筑的區分點就是批準期末，批準期初至批準期末為合法建筑，超過批準期末，仍未拆除的，為違章建筑。筆者認為，并非所有的轉化的違章建筑，在拆除時，都不予補償。如果存在以下兩種情況：(一)不可抗力阻礙臨時建筑在批準期限內拆除的;(二)臨時建筑不被拆除是為了保護另外一個更大的利益，致使超過批準期限仍未拆除的。在這兩種情況下，拆遷人拆除違章建筑時，應當按照國家或者地方的標準補償違章建筑人。

比如，違章建筑的承租人履行了一般情況下的注意義務，仍然對其承租的房屋系違章建筑不知情，拆遷人如果拆除該違章建筑，應當依法對該房屋承租人補償安置。從法理的角度分析，任何人不應當由于第三人的原因喪失其合法權益。拆遷人不能由于違章建筑人的過錯拒絕對對違章建筑使用人補償安置。