1、合并方和被合并企業的初步確定一般通過產權市場或直接協商確定合并方和被合并企業。在實踐中，由于現有產權市場存在諸多不規范之處，企業采取兼并重組的形式，通過直接協商或自謀對象來確定兼并方和被兼并企業的情況較為普遍，對被合并企業的各項資產、負債進行全面、認真的清查，理清債權債務關系。按照“誰投資、誰所有、誰受益”的原則，對國有資本及其權益進行核定和界定，防止企業并購過程中國有資產流失，國有產權直接持有單位必須決定聘請有資質的會計師事務所進行財務審計。企業合并后轉為非國有企業的，應當對企業法定代表人進行審計。被合并企業必須按照有關規定向會計師事務所或者政府審計部門提供有關財務會計資料和文件

采用合并重組形式的資產評估企業，必須按照本法的規定進行資產評估國有資產評估管理辦法。為防止國有資產流失，對合并中轉制為股份制企業的企業也應進行資產評估。資產評估范圍包括固定資產、流動資產、無形資產（包括知識產權和商譽，但不包括作為無形資產處理的國有土地使用權）和其他資產。非國有投資者并購企業的，由直接持有國有產權的單位決定聘請有資質的資產評估機構進行資產評估。其他形式的合并，應當按照《國有資產評估管理辦法》的規定對國有資產進行評估。首先，被合并企業應當向國有資產管理部門申請進行項目評估，并提交財產目錄和有關會計報表，由國有資產管理行政部門進行審計。國有資產管理部門批準評估項目的，申請人應當委托評估機構進行評估。持有國務院或者省、自治區、直轄市人民政府國有資產評估資質證書的資產評估公司、會計師事務所、審計事務所、財務咨詢公司，以及國務院國有資產管理部門或者省、自治區、直轄市人民政府依照現行法律、法規和政策規定認定的臨時評估機構，被合并企業應當委托上述單位進行資產評估，不得接受上述機構的委托進行資產評估。資產評估機構接受委托進行資產評估、估計后，應當將資產評估結果報告報送委托單位，委托人將資產評估報告報送其主管部門審核，經主管部門審批后，報同級國有資產管理部門確認資產評估結果。經確認的資產評估結果，由國有資產管理行政主管部門出具確認通知書。未經資產評估而簽訂的銷售協議，視為無效。（4）確定產權底價時，被合并企業應當根據有關主管部門確認的評估值合理確定銷售底價。交易價格可通過招標確定。成交價格不得低于底價（但允許在底價的基礎上有一定程度的浮動）。浮動價格低于評估價格90%的，由同級國有資產管理部門批準。未按規定進行評估的，不予辦理產權變更手續。采用招標投標方式確定成交價格的，依照招標投標法的規定辦理。有自謀對象的企業合并，可以協商，但協商價格不得低于評估值確定的底價。被合并企業為全民所有制企業的，由國有資產管理部門確定交易價格

交易價格確定后，雙方所有者應當簽訂合并協議。全民所有制企業合并，由各級國有資產管理部門審批。尚未設立國有資產管理部門的，由財政部門會同企業主管部門報同級政府決定。為使并購工作順利進行，應征求被并購企業職工的意見，做好職工的思想工作。職工不同意合并的，不影響合并協議的效力。集體所有制企業合并，應當經職工代表大會討論批準，報主管部門備案。集體所有制企業未經職工代表大會批準合并的，合并協議不生效。合并協議因未獲通過而無效的，依照合同法關于締約過失責任的規定處理，實施合同、租賃制度的企業確定合并時，應當按照有關規定辦理解除合同手續。未辦理終止合同手續的企業不得合并。合并的，合并方應當按照有關法律、法規的規定一次性支付價款；一次性支付確有困難的，經雙方協商，經批準國有企業改制和國有產權轉讓的單位按照有關規定批準，可以分期支付。分期付款的，首付款不得低于價款的30%，其余由受讓人依法擔保，自首付款之日起一年內支付。買方應參照銀行貸款利率向賣方支付未付部分的利息。國有產權轉移支付的資金，優先支付解除勞動合同職工的經濟補償金，優先支付轉移到社會保障機構管理的職工的社會保險費，償還企業欠職工的債務和社會保險費。剩余部分按有關規定處理

此外，為保護債權金融機構的利益，《關于規范國有企業改制的意見》規定，在改制過程中，必須征得債權金融機構的同意，維護金融債權，依法履行金融債務。未履行金融債務的企業不得重組

合并協議自雙方簽字蓋章之日起生效。需要經政府主管部門批準的，合并協議自批準之日起生效；未經批準，合并協議不得生效。但根據《合同法》及其相關司法解釋，當事人在一審法院辯論終結前辦理核準手續的，合并協議有效

被合并企業產權轉讓所得屬于企業產權所有人。被合并企業為全民所有的，除國家另有規定外，其凈收入由國有資產管理部門上繳國庫。被合并企業屬于集體所有制的，其凈收入按產權歸屬歸屬屬于不同所有者的，企業合并后應當辦理產權變更登記（含產權變更登記）