高新技術企業的認定程序有五個環節，包括自評、登記、材料準備和提交、組織評審和認定、公示和頒發證書。申請人應完成前三項，其中材料準備是最重要的。《工作指南》第二（3）項列出了需要提交的材料類型，包括認可申請、兩份保證報告（近三個會計年度研發費用保證報告、，最近三個會計年度的財務報表，包括資產負債表、利潤及利潤分配表、現金流量表（實際使用年限不足三年的，以實際經營使用年限為準），審計報告（最近一個會計年度高科技產品（服務）收入專項審計報告）和技術創新活動的支持材料，《高新技術企業認定申請表》由企業基本情況表、企業研究開發項目表、上年度高新技術產品（服務）表、企業基本情況表五種形式組成，近三年取得的自主知識產權匯總表和企業年度研發成本結構明細表，填寫時應注意所有財務數據均來自專項審計報告，應與鑒證報告和審計報告完全一致。企業基本信息表中“近三年取得自主知識產權數量”一欄填寫的內容應與“人力資源”一欄中“技術創新活動支持材料”相對應并完全一致，注意兩個比例要求，即大專以上科技人員占當年職工總數的30%以上，研發人員占職工總數的10%以上；其他文字說明的內容多以數據描述，較少華麗的文字和句子，并注重簡潔和全面

在高新技術企業認定申請中，研發費用的歸集和核算是一項基礎性和重要的工作。這不僅關系到確認申請能否通過，還關系到企業所得稅計算中技術開發費用的增減，對企業利益影響很大。提醒企業注意以下幾個方面：

提示2：企業應設立專門的科研人員名冊，以便在申請認可時核實科研人員的比例要求；另一方面，便于成本歸集中的相互通信。企業應當與科研人員簽訂勞動合同，繳納社會保險。強調企業科技人員的工作時間不少于半年（183天）。支付科研人員人工成本時，可考慮集中制表，并與勞動合同一致

提示3：設備折舊和研發后無形資產攤銷可直接計算。企業可根據批準的研發立項報告，將“固定資產”和“無形資產”的管理部門調整給研發機構，為了正確計算折舊和攤銷金額，提示4：設計（規劃）成本和設備調試成本應有法律依據。這些費用往往發生在企業內部，沒有許多外部原始憑證，事后難以收集和核實，如設備調試數量、每次用電量、相關技術工人的勞動力等。因此，企業應按照內部會計的要求做好原始記錄和憑證，及時辦理審批手續，逐月結算

提示5：委托外部研發費用時，關注項目成果和與企業主營業務的密切關系，是衡量外部研發費用能否計入的重要因素。簽訂委托合同時，應特別注明。此外，所有發生的外部研發費用在申請確認時只能按80%計算，雖然《認定辦法》明確規定高新技術企業的認定不需經過主管稅務機關，但在計算加計和減計時沒有此類限制，企業仍應注意與主管稅務機關的溝通，及時了解和掌握當地有關認定的具體規定。企業取得高新技術企業資格后，應當及時將證書通知主管稅務機關，不得在申報企業所得稅時將證書取出。免稅、減稅條件發生變化的，應當在15日內報告；如果您不符合條件，請主動納稅以避免被追繳，承擔滯納金并留下不良記錄