高新技術(shù)企業(yè)的認(rèn)定程序有五個環(huán)節(jié)，包括自評、登記、材料準(zhǔn)備和提交、組織評審和認(rèn)定、公示和頒發(fā)證書。申請人應(yīng)完成前三項，其中材料準(zhǔn)備是最重要的。《工作指南》第二（3）項列出了需要提交的材料類型，包括認(rèn)可申請、兩份保證報告（近三個會計年度研發(fā)費用保證報告、，最近三個會計年度的財務(wù)報表，包括資產(chǎn)負(fù)債表、利潤及利潤分配表、現(xiàn)金流量表（實際使用年限不足三年的，以實際經(jīng)營使用年限為準(zhǔn)），審計報告（最近一個會計年度高科技產(chǎn)品（服務(wù)）收入專項審計報告）和技術(shù)創(chuàng)新活動的支持材料，《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請表》由企業(yè)基本情況表、企業(yè)研究開發(fā)項目表、上年度高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）表、企業(yè)基本情況表五種形式組成，近三年取得的自主知識產(chǎn)權(quán)匯總表和企業(yè)年度研發(fā)成本結(jié)構(gòu)明細(xì)表，填寫時應(yīng)注意所有財務(wù)數(shù)據(jù)均來自專項審計報告，應(yīng)與鑒證報告和審計報告完全一致。企業(yè)基本信息表中“近三年取得自主知識產(chǎn)權(quán)數(shù)量”一欄填寫的內(nèi)容應(yīng)與“人力資源”一欄中“技術(shù)創(chuàng)新活動支持材料”相對應(yīng)并完全一致，注意兩個比例要求，即大專以上科技人員占當(dāng)年職工總數(shù)的30%以上，研發(fā)人員占職工總數(shù)的10%以上；其他文字說明的內(nèi)容多以數(shù)據(jù)描述，較少華麗的文字和句子，并注重簡潔和全面

在高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請中，研發(fā)費用的歸集和核算是一項基礎(chǔ)性和重要的工作。這不僅關(guān)系到確認(rèn)申請能否通過，還關(guān)系到企業(yè)所得稅計算中技術(shù)開發(fā)費用的增減，對企業(yè)利益影響很大。提醒企業(yè)注意以下幾個方面：

提示2：企業(yè)應(yīng)設(shè)立專門的科研人員名冊，以便在申請認(rèn)可時核實科研人員的比例要求；另一方面，便于成本歸集中的相互通信。企業(yè)應(yīng)當(dāng)與科研人員簽訂勞動合同，繳納社會保險。強調(diào)企業(yè)科技人員的工作時間不少于半年（183天）。支付科研人員人工成本時，可考慮集中制表，并與勞動合同一致

提示3：設(shè)備折舊和研發(fā)后無形資產(chǎn)攤銷可直接計算。企業(yè)可根據(jù)批準(zhǔn)的研發(fā)立項報告，將“固定資產(chǎn)”和“無形資產(chǎn)”的管理部門調(diào)整給研發(fā)機構(gòu)，為了正確計算折舊和攤銷金額，提示4：設(shè)計（規(guī)劃）成本和設(shè)備調(diào)試成本應(yīng)有法律依據(jù)。這些費用往往發(fā)生在企業(yè)內(nèi)部，沒有許多外部原始憑證，事后難以收集和核實，如設(shè)備調(diào)試數(shù)量、每次用電量、相關(guān)技術(shù)工人的勞動力等。因此，企業(yè)應(yīng)按照內(nèi)部會計的要求做好原始記錄和憑證，及時辦理審批手續(xù)，逐月結(jié)算

提示5：委托外部研發(fā)費用時，關(guān)注項目成果和與企業(yè)主營業(yè)務(wù)的密切關(guān)系，是衡量外部研發(fā)費用能否計入的重要因素。簽訂委托合同時，應(yīng)特別注明。此外，所有發(fā)生的外部研發(fā)費用在申請確認(rèn)時只能按80%計算，雖然《認(rèn)定辦法》明確規(guī)定高新技術(shù)企業(yè)的認(rèn)定不需經(jīng)過主管稅務(wù)機關(guān)，但在計算加計和減計時沒有此類限制，企業(yè)仍應(yīng)注意與主管稅務(wù)機關(guān)的溝通，及時了解和掌握當(dāng)?shù)赜嘘P(guān)認(rèn)定的具體規(guī)定。企業(yè)取得高新技術(shù)企業(yè)資格后，應(yīng)當(dāng)及時將證書通知主管稅務(wù)機關(guān)，不得在申報企業(yè)所得稅時將證書取出。免稅、減稅條件發(fā)生變化的，應(yīng)當(dāng)在15日內(nèi)報告；如果您不符合條件，請主動納稅以避免被追繳，承擔(dān)滯納金并留下不良記錄