如果確實公司存在債務的，人民法院會判決公司償還債務，如果公司不償還的，當事人可以申請強制執行。

如果防止公司債務糾紛：

一、防患于未然是維護企業自身權益的前提

防患于未然,是維護企業自身權益的前提基礎，因為債務糾紛在許多情況下是可以避免的。現代交易,實際上就是合同交易,是口頭或書面合同的具體履行.但是合同在訂立履行時會遇到很多風險。所以在合同訂立時不要使用含糊不確定的詞語，要知道，合同中的每一個條款,每一句話,每一個字,甚至每一個標點符號都是十分重要的.千萬不要忽視合同細節。為了預防日后債務糾紛的發生，最好的辦法就是讓對方在簽訂合同時進行擔保。

二、積極催要貨款避免企業陷入債務糾紛

中國人向來講人情，重友誼，看發展，認為催款太緊會使對方不愉快，影響以后的交易，一般不到最后日期，不愿意行使自己作為債權人的權利。其實，這是一種錯誤觀念。如果總是擔心對方不高興，那么永遠都會收不到貨款，而且未必保證以后的交易能順利進行。客戶所欠貨款越多，支付越困難，越容易轉向第三方購買，我們就越不能穩住這一客戶，所以還是加緊催收才是上策，否則超出了訴訟時效就會無法挽回損失。只有錢貨兩清，才能繼續洽談新的生意。催收貨款若不理直氣壯，就會被對方牽著鼻子走，本來能夠收回的貨款也有可能收不回來。所以，催要貨款時最好直截了當的表明自己的來意，不要讓對方認為延期還款是理所應當的。

三、靈活運用法律規則是企業維護自身權益的最后保障

在遇到公司債務糾紛的時候，要考慮用法律手段來維護自己的權益了。訴訟是最有效的維權手段。企業用訴訟手段來維權時，一定要及時準確。通過訴訟途徑解決債務糾紛雖然具有效力強、權威高的優點，但確也存在成本高、時間長等問題。如果靈活選取和運用其它的法律規則，可一定程度避免上述問題，從而控制成本、提高效率、降低風險，具體來講有以下幾種辦法：

(1)靈活約定仲裁

在合同簽定時，如果面臨標的大、對方履約誠信差、以及地方保護主義嚴重等情形時，一般可以采用仲裁的方式，仲裁具有的專業性、靈活性、保密性、快捷性、經濟性、獨立性的特點以及一裁終局的規定，就可以使我們減少成本，縮短時間，提高效率，減少訴訟帶來的麻煩。

(2)適當采納公證

在合同簽定的時侯，也可以通過當地公證處進行公證，公證書具有比其他單位和個人提供的證明文件更高的證據能力，司法機關和仲裁機關一般無須審查就可以直接作為認定事實的根據。對于經過公證的合同，在一方違約時，由于公證具有強制執行的效力，對于不履約的經過公證的合同，可以提交法院申請強制執行。

(3)巧妙選取代理

在異地訴訟的時候，由于地方保護主義的干擾，對方當事人具有“主場優勢”，因此為了保證訴訟取得良好的效果，在必要的時候選取一定的代理機構，對于債務的解決也具有潤滑和加持的作用。

(4)適時申請支付令

當雙方是金錢債務糾紛，并且在債權債務關系清晰的時候，債權人通過向法院申請支付令，由法院向對方當事人發送支付令，在規定時期不履行時，可通過法院強制執行。缺點是一旦對方提出異議，就要進入普通訴訟程序，所以具有不確定的因素。

以上就是小編為您整理的內容，一個企業在運行的過程中會遇到很多的債務糾紛，在處理的的時候，要合理的利用法律的武器維護自己的權利，如果你情況比較復雜，律霸網也提供律師在線咨詢服務，歡迎您進行法律咨詢。