海關(guān)在收到企業(yè)反饋的稽查報告之日起30日內(nèi)作出《海關(guān)稽查結(jié)論》，并送達(dá)企業(yè)。稽查結(jié)束。海關(guān)在稽查中發(fā)現(xiàn)企業(yè)有走私、違反海關(guān)監(jiān)管規(guī)定行為嫌疑的，海關(guān)予以立案調(diào)查。具體的稽查流程是：

1、通知

海關(guān)決定對企業(yè)實(shí)施稽查時，提前3日將《海關(guān)稽查通知書》送達(dá)企業(yè)，企業(yè)收到通知書后應(yīng)及時與海關(guān)聯(lián)系，并按通知中的稽查范圍準(zhǔn)備相應(yīng)帳冊、業(yè)務(wù)單證及有關(guān)資料。

當(dāng)企業(yè)有重大違法嫌疑，企業(yè)的會計帳簿、會計憑證、會計報表、會計電算化資料、報關(guān)單證等有關(guān)資料或進(jìn)出口貨物可能被擅自轉(zhuǎn)移或毀棄，以及特殊情況海關(guān)認(rèn)為有必要時，海關(guān)可不事先通知企業(yè)而徑行稽查。徑行稽查時海關(guān)將《海關(guān)稽查通知書》當(dāng)面送達(dá)企業(yè)。

2、實(shí)施

海關(guān)實(shí)施稽查時，企業(yè)應(yīng)配合海關(guān)稽查工作，其法定代表人或主要負(fù)責(zé)人或其授權(quán)代表應(yīng)到場，如實(shí)反映情況，并提供必要的工作條件。

此階段，海關(guān)稽查人員查閱、復(fù)制企業(yè)的帳簿、單證等有關(guān)資料。企業(yè)應(yīng)按海關(guān)要求提供有關(guān)資料，協(xié)助清點(diǎn)、復(fù)制，并在復(fù)印件上簽字、蓋章。企業(yè)所在地不具備查閱或復(fù)制帳簿、單證等有關(guān)資料的工作條件或者其他原因稽查組需要在其他場所進(jìn)行查閱、復(fù)制的，由稽查組制發(fā)《帳簿單證調(diào)審單》，實(shí)施異地查閱或者復(fù)制。當(dāng)海關(guān)稽查人員認(rèn)為有必要時，可對企業(yè)有關(guān)人員制作《詢問筆錄》，企業(yè)有關(guān)人員應(yīng)如實(shí)回答海關(guān)工作人員的提問，詢問結(jié)束后在《詢問筆錄》上簽字(蓋章)

當(dāng)海關(guān)稽查人員認(rèn)為有必要的，可對企業(yè)的生產(chǎn)經(jīng)營場所和進(jìn)出口貨物存放場所進(jìn)行檢查。檢查時，企業(yè)的法定代表人或主要負(fù)責(zé)人或其授權(quán)代表應(yīng)到場，按照海關(guān)的要求開啟場所、搬移貨物，開啟、重封貨物的包裝。檢查結(jié)束后，企業(yè)應(yīng)在海關(guān)工作人員填寫的《檢查記錄》上簽字(蓋章)

當(dāng)海關(guān)稽查人員認(rèn)為有必要的，可對企業(yè)的帳簿、單證等有關(guān)資料和進(jìn)出口貨物實(shí)施封存。封存時海關(guān)出具《封存通知書》，并對帳簿、單證等有關(guān)資料和貨物加貼海關(guān)專用封志。企業(yè)在對封存物清點(diǎn)后應(yīng)當(dāng)在《封存通知書》所附清單上簽字(蓋章)

3、報告

海關(guān)稽查人員根據(jù)稽查情況撰寫稽查報告，并征求企業(yè)意見。

企業(yè)收到稽查報告后，應(yīng)在7日內(nèi)向稽查組提出書面意見，逾期未提交的，視為無意見。