1.研究擬定有關出入境衛生檢疫、動植物檢疫及進出口商品檢驗法律、法規和政策規定的實施細則、辦法及工作規程,督促檢查出入境檢驗檢疫機構貫徹執行;
2.組織實施出入境檢驗檢疫、鑒定和監督管理;負責國家實行進口許可制度的民用商品入境驗證管理;組織進出口商品檢驗檢疫的前期監督和后續管理;
3.組織實施出入境衛生檢疫、傳染病監測和衛生監督;組織實施出入境動植物檢疫和監督管理;負責進出口食品衛生、質量的檢驗、監督和管理工作;
4.組織實施進出口商品法定檢驗;組織管理進出口商品鑒定和外商投資財產鑒定;審查批準法定檢驗商品的免驗和組織辦理復驗;
5.組織對進出口食品及其生產單位的衛生注冊登記及對外注冊管理;管理出入境檢驗檢疫標志、進口安全質量許可、出口質量許可并負責監督檢查;管理和組織實施與進出口有關的質量認證認可工作;
6.負責涉外檢驗檢疫和鑒定機構(含中外合資、合作的檢驗、鑒定機構)的審核認可并依法進行監督;
7.負責商品普惠制原產地證和一般原產地證的簽證管理;
8.負責管理出入境檢驗檢疫業務的統計工作和國外疫情的收集、分析、整理,提供信息指導和咨詢服務;
9.擬定出入境檢驗檢疫科技發展規劃;組織有關科研和技術引進工作;收集和提供檢驗檢疫技術情報;
10.垂直管理出入境檢驗檢疫機構;
11.開展有關的國際合作與技術交流,按規定承擔技術性貿易措施和檢疫協議的實施工作,執行有關協議。
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