股權變更登記生效了代表在公法意義上股權變更得到了確認，但對股權變更并沒有實質影響，實際上的股權變更的生效還是取決于公司的股權名冊變更。

一、有限公司的股權轉讓一般要經過如下程序：

1、程序合法

向股東以外的第三人轉讓股權的，由轉讓股權的股東向公司董事會提出申請，由董事會提交股東會討論表決;股東之間轉讓股權的，不需經過股東會表決同意，只要通知公司及其他股東即可。

2、轉讓協議

雙方簽訂股權轉讓協議，對轉讓股權的數額、價格、程序、雙方的權利和義務做出具體規定，使其作為有效的法律文書來約束和規范雙方的行為。股權轉讓合同應當遵守合同法的一般規定。

3、注意事項

在轉讓股權過程中，凡涉及國有資產的，為防止國有資產流失，根據國務院發布的《國有資產評估辦法》第三條的規定，如對國有資產拍賣、轉讓、企業兼并、出售等，都應進行資產評估。股權轉讓的價格一般不能低于該股權所含凈資產的價值。

對于中外合資或中外合作的有限公司股權轉讓的，根據現行《中外合資企業法》、《中外合作企業法》的規定，要經中方股東的上級主管部門同意，并報原審批機關審批同意以后方可辦理轉讓手續。

收回原股東的出資證明，發給新股東出資證明，對公司股東名冊進行變更登記，注銷原股東名冊，將新股東的姓名或名稱，住所地及受讓的出資額記載于股東名冊，并相應修改公司章程。但出資證明書作為公司對股東履行出資義務和享有股權的證明，只是股東對抗公司的證明，并不足以產生對外公示的效力。

將新修改的公司章程，股東及其出資變更等向工商行政管理部門進行工商變更登記。至此，有限責任公司股權轉讓的法定程序才告完成。

二、股權變更登記與股權轉讓合同的生效

所謂合同的生效，是指已經成立的合同在當事人之間產生一定的法律效力，它是國家權力對當事人意思自治的干預，表明了國家對當事人行為的評判和取舍，以保證當事人實現其預期的合同日的。合同的生效要件屬價值判斷，體現了國家意志，體現了國家對當事人之間業已成立的合同關系品質的評判，這些要件是法律通過強制性規定所確立的，不是當事人通過意思自治可以解決的。按照合同法第44條的規定，依法成立的合同，自合同成立時生效。法律、行政法規規定應當辦理批準、登記等手續的，依照其規定。

就股權轉讓而言，我國現行立法并未規定轉讓合同必須在辦理工商登記后才能生效，現有規定主要對國有股權的轉讓進行一定的限制，即國有股權的轉讓必須經過政府或者主管部門的批準。換言之，如果國有股權的轉讓未經過批準，股權轉讓合同不會發生預期的效力。對于有限責任公司來說，由于它的人合性特點，其股權的轉讓：還有其特殊性。為了保障股東彼此之間的相互信賴，保證股東人員的穩定性，立法對股東向股東以外的人轉讓出資作出了限制。按照《公司法》第35條的規定，股東向股東以外的人轉讓其出資時，必須經全體股東過半數同意;不同意轉讓的股東應當購買該轉讓的出資，如果不購買該轉讓的出資，視為同意轉讓。并且-經股東同意轉讓的出資，在同等條件下，其他股東對該出資有優先購買權。該條規定雖然從程序上對股東向外轉讓股權進行了一定的限制，但反對的股東如果不購買則視為同意，所以并不能從實體上否定股權轉讓的效力。另外，最高人民法院《關于審理公司糾紛案件若干問題的規定(一)》(征求意見稿2)(以下簡稱《征求意見稿2》)第24條規定，有限責任公司股東未經其他股東過半數同意而與非股東訂立股權轉讓合同，其他股東可以請求法院撤銷該合同，這也表明司法解釋的本意是承認股權轉讓合同業已生效，只是其他股東享有撤銷權而已?？偠灾?，合同應當在成立時即告生效，廠商變更登記和其他股東的優先購買權不能成為股權轉讓：合同的生效要件。

三、公司股權轉讓涉及哪些稅收？

1、企業所得稅：企業股權投資轉讓所得應并入企業的應納稅所得，依法繳納企業所得稅。企業股權投資轉讓所得或損失是指企業因收回、轉讓或清算處置股權投資的收入減除股權投資成本后的余額。

2、營業稅：《營業稅稅目注釋(試行稿)》對此作出了明確規定：“以不動產(無形資產)投資入股，參與接受投資方利潤分配、共同承擔投資風險的行為，不征營業稅。但轉讓該項股權，應按本稅目征稅”。

3、個人所得稅：根據個人所得稅法規的有關規定，個人轉讓股權應按“財產轉讓所得”項目依20%的稅率計算繳納個人所得稅。財產轉讓所得，以轉讓財產的收入額減除財產原值和(合理費用)后的余額為應納稅所得額。

4、印花稅

律霸網小編提醒大家在一些股權變更轉讓的過程中，一定要去做相應的變更登記等行為，這樣可以保護大家的利益，在發生糾紛的時候有法可依。